Accessible uniquement depuis la passerelle, le bureau du capitaine est le lieu où il peut travailer sur différentes tâches administratives grâce à tous les équipements de bureau nécessaire.
Le capitaine dispose également d'un accés aux communications externes, par le biais d'un réseau personnel et sécurisé.
La place accordée au bureau du capitaine dans l'univers miroir est plus importante que pour l'Akira de l'univers "normal".
Celui-ci est divisé en deux parties, la première étant destinée entiérement aux opérations, la seconde est un salon qui permet au capitaine de tenir des réunions privés avec plusieurs personnes.
Les conversations peuvent être agrémentées avec de la nourriture et des boissons sorties d'un synthétiseur.